CDS

Accession Number TCMCG051C03638
gbkey CDS
Protein Id XP_002298478.3
Location 28386936..28389923
Gene LOC7496777
GeneID 7496777
Organism Populus trichocarpa

Protein

Length 995aa
Molecule type protein
Topology linear
Data_file_division PLN
dblink BioProject:PRJNA17973
db_source XM_002298442.3
Definition integrator complex subunit 3 homolog [Populus trichocarpa]

EGGNOG-MAPPER Annotation

COG_category S
Description Integrator complex subunit
KEGG_TC -
KEGG_Module -
KEGG_Reaction -
KEGG_rclass -
BRITE ko00000        [VIEW IN KEGG]
ko03041        [VIEW IN KEGG]
KEGG_ko ko:K13140        [VIEW IN KEGG]
EC -
KEGG_Pathway -
GOs -

Sequence

CDS:  
ATGGCATCAAAGCTGCTTAAACTCACTGCCTATGAGGCCAAAAACGAGCTTGAACTCTCTCTAAAGCAAGCCTTCGAGGAGCTTGAACCAAAACTAAGACCCCCATTTCCATTAACAATACCAAGCCCTCAAGAATATTCCAGACTCAATCTTGCTATTCTTTATGGGGTTTTAACCGAACCCCTTTTAGCTAAAACGCATATAAAGCATCTTCATGCTATTGTCACTGATGGGTATGCTTTGTTTGTTAGTTTGATTGTGAAAATTGTTAATGATTTGTATGGCAAGTTAGTTGATTCGGTGAAGGATCAATTGGTTTGGGTTGTTAAAGAAATGGTTGATGTTTTAGGAGTGGGATTTGATGGTTTCTTAGTGTGTTTGTTGAGGCAGATTGTTGGTGGGGATTTTAGTGATGGGAATTTGTGGTTGTGCTTTGAGTTGGTCTCCCTTTTTTCAAGCAAATGGGATTGTTTAGTAGAAGATGCGCCATTTGTTTTAACTAGTGCTTTGTATGTGTATCTACGGGTATTAGCTGATCATTGTAAGGTATCGACTGATGCTAAGATGGAATCGTTGAAAAGATTAGAGATTGAGTTTTGTGTCAAGATGTTGAGGGAGCAATTTAATTTGTGCATGAAGATTGGGAGGGACCTTATTAGATTGCTTCGAGATTTGGTTCATGTCCCTGAGTTTCGAGCTATCTGGAATGATTTGGTGTCGAACCCAAGTGAATTTAGGACAGAAGGATTTTCAGATATTTCACAGTTGTACTGCTCTAGGACTTCTAGTCGGTATTTTTTGCTTCGAATTACTCCAGAGATGGAAACCCAATTGAGGTTTCTACTCATGCATGTGAAGTTTGGGAATCAGAAGCGATACCAAGTGTGGTTTGCCAAGAAGTTTCTTTTTGGACAAGAGAGAGAGACACTTGTAGTTGACATTATTCGCTTCATATGTTGTGCACACCACCCATCAAATGAAATTATTCAGTCAGACATTGTACCAAGATGGGCTGTTATAGGTTGGCTTCTAAAATCTTGTAGAGAAAAATATGTTGAAGCTAATATGAAGCTGGCCTTATTTTATGACTGGCTTTTTTTTGATGAAAAAATTGACAACATAATGAACATTGAGCCTGCAATGCTATTAATGGTATGCTCAATACCAAAATATATAGATATAACTCACTCTCTTCTTGAATTTTTATTGTTTATTGCTGAAAACTATGAAGAGGACCGTAATTATGTCATTAGAAGGGGTTTGTCATCAGCTATGAGGATGCTTGTTCAAAAAGGAGTGGTTCGGTCAATGGATATTCTGACTTCATGTGATGCACTTTCTCCTTTTCTAAGAGAGGGACTTAGGAAGTTAATATTGCGTTTGAATATTGAACGTAATGAGTTGCAACCAGCCCATCTTCCTCCTCATTCTGTGTCACGTTCGAGTTTGCAAAATGTTTCTCATCTTGCAATAACAACACCAGCTCCGGAACAACAATCTGCAAAGATTGTGGAAGTAAGGCTTAGCAAAGAACCTGCTGGTTCTTCTATTCCCATTTCAGGTGACCTGTTTACTACTTCTTGCCCATCAAATGTTACCATTGAAAGTCAATTTGATGCTATTGAGAGCCTAGCACAAAATCTGGCAGAAGCTATGAAGAAGTCAAATAGAATGGGGCTTCAGATTTTGGAGGAAATACTTCTCTCATATGTGAATCTTGATGGCCAAGCATCAACATGTGGTTCAACTTTCCCTGAAACTTTATCTTCAAGAATTGCAGATCAATTTGAATCCGTTGGCAATCGATTATTTGCTCCTTTTGATGTCAGCATTAGTGTTCCTTCTTCTGACAGTGGAATTCATTCGCCCACAATCTTAATTGCACGCTCCTTCATACTTTCTCAGCATGAACGGTTGCAAGAAATGCTTCTATTCTGGTCAAGGAATGGTTTTCATGTAGGAGCTCACTTACTATCTTATGCAACAAGGCTAGCTTATGAGGCATGTATATCAGATTCTTCAGGAAATGCAATCATCAACAATAATTTTTCTAAGATAAGTGACTCAGGGATGTCATTATTACTCTTTCATGTTGATGGGTATTTTTCTATTCTGAATGGAAGGAAACAAGATTTTCTCGAAGGCAGTGTTTCTACTTCTAAGATGGATAAGGAATTAGTTAATATGTTGGTAAAAAATGCTTTTGCTGCATACAAATGTTTCCTCGAACGTTCAAGAACCATCCTGCATAAAGAAGATGATTTAGCTCTGTCAAAGCTATTCATTCTAGACATAACCTCTTGTTTTCTTTGTGAAAGAAAAAAGACAAAGTTCTTCTACAGCATCTTCTGTCATCTTGCCGACTTATGTGCTGGCAACATTGATATCATCAGGTTCCTTGTGAGTCAGTTGGATCATGCTGATCTTCTTGAAATGCAGTTTGAAATTGGGCTGAAGAGATTCTTCGTGTTCGGGGAGAGCACTGAAGATATTTTTCACTTAATGAAGAACTCTCTCAGTTGGGATCCTTCAGAGCAGCACAAGCTTTGGGGCTTGATCAGATCAGAGCTTGCTGTTTCTAAGGTTCAGCTGGAGAAGATCATTTTGAAAATTTTCTGCTCTAATGAGCTGGATGCAAATACAAGTGCCATTGCTGTGGGAGGCCTTCTTACATTGTGCATTTGCCGTGCTCCCACACCTGAGCTTGTTGGGGCAATCATGTTACTGCCTGATGATGTATTCCAGGACTTTGCTGCTACAGTTTTGGCATCATGGGTTGTCTCTAATGCCTCAAAGCTATTTGACAGCTTGACTAAATTTTCAGAGAAATTTGACAATGAGAATGGAAATGTTGCTGGTTCAGTTGGGATTGTGATAAACCATTCTGCAATTCTCTGGTTGTTGAATTATTTTAAATCACAGGGGATGAATGGCTCCAATTTTTTAAGCACCTTTTCTGCAAGTATTTCTTGTGAAAAACCAGCATAG
Protein:  
MASKLLKLTAYEAKNELELSLKQAFEELEPKLRPPFPLTIPSPQEYSRLNLAILYGVLTEPLLAKTHIKHLHAIVTDGYALFVSLIVKIVNDLYGKLVDSVKDQLVWVVKEMVDVLGVGFDGFLVCLLRQIVGGDFSDGNLWLCFELVSLFSSKWDCLVEDAPFVLTSALYVYLRVLADHCKVSTDAKMESLKRLEIEFCVKMLREQFNLCMKIGRDLIRLLRDLVHVPEFRAIWNDLVSNPSEFRTEGFSDISQLYCSRTSSRYFLLRITPEMETQLRFLLMHVKFGNQKRYQVWFAKKFLFGQERETLVVDIIRFICCAHHPSNEIIQSDIVPRWAVIGWLLKSCREKYVEANMKLALFYDWLFFDEKIDNIMNIEPAMLLMVCSIPKYIDITHSLLEFLLFIAENYEEDRNYVIRRGLSSAMRMLVQKGVVRSMDILTSCDALSPFLREGLRKLILRLNIERNELQPAHLPPHSVSRSSLQNVSHLAITTPAPEQQSAKIVEVRLSKEPAGSSIPISGDLFTTSCPSNVTIESQFDAIESLAQNLAEAMKKSNRMGLQILEEILLSYVNLDGQASTCGSTFPETLSSRIADQFESVGNRLFAPFDVSISVPSSDSGIHSPTILIARSFILSQHERLQEMLLFWSRNGFHVGAHLLSYATRLAYEACISDSSGNAIINNNFSKISDSGMSLLLFHVDGYFSILNGRKQDFLEGSVSTSKMDKELVNMLVKNAFAAYKCFLERSRTILHKEDDLALSKLFILDITSCFLCERKKTKFFYSIFCHLADLCAGNIDIIRFLVSQLDHADLLEMQFEIGLKRFFVFGESTEDIFHLMKNSLSWDPSEQHKLWGLIRSELAVSKVQLEKIILKIFCSNELDANTSAIAVGGLLTLCICRAPTPELVGAIMLLPDDVFQDFAATVLASWVVSNASKLFDSLTKFSEKFDNENGNVAGSVGIVINHSAILWLLNYFKSQGMNGSNFLSTFSASISCEKPA